Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP9O75884 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP9O75884 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms