Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JRKO75564 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JRKO75564 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JRKO75564 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms