Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms