Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUBNO60494 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUBNO60494 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUBNO60494 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUBNO60494 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUBNO60494 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUBNO60494 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUBNO60494 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUBNO60494 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms