Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPLO60437 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PPLO60437 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPLO60437 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPLO60437 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPLO60437 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPLO60437 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPLO60437 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPLO60437 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPLO60437 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPLO60437 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPLO60437 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PPLO60437 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms