Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms