Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms