Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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