Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms