Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCAO15360 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCAO15360 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCAO15360 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCAO15360 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCAO15360 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCAO15360 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCAO15360 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms