Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBDO15205 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBDO15205 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms