Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC80O14777 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC80O14777 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC80O14777 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC80O14777 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NDC80O14777 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NDC80O14777 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC80O14777 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC80O14777 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms