Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASTN1O14525 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASTN1O14525 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms