Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF5O00463 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms