Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KR12 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3KR12 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3KR12 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3KR12 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KR12 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KR12 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KR12 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms