Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms