Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms