Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms