Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms