Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms