Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms