Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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