Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 PHACTR1-205ENST00000379350 4784 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RYR3Q15413 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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