Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3B2Q13367 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3B2Q13367 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms