Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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