Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms