Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms