Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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