Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZNF43-202ENST00000357491 5249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms