Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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