Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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COL4A6Q14031 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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