Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms