Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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