Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms