Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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