Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms