Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR3

KRTAP4-4, Keratin-associated protein 4-4, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 STEAP3-203ENST00000393110 4262 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 FAM86B3P-202ENST00000522601 1409 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SYS1-204ENST00000426004 2915 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TNFAIP3-201ENST00000237289 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC17A2-201ENST00000265425 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 PRRG3-201ENST00000370353 5977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 IMPDH1P10-201ENST00000440965 1542 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 AMT-236ENST00000636597 1509 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TUFT1-203ENST00000368849 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SEPT4-204ENST00000412945 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ENTPD1-210ENST00000543964 1579 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 AC098850.5-201ENST00000602730 3243 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01140-210ENST00000590653 3315 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 PRAMEF8-203ENST00000621519 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 COL10A1-202ENST00000327673 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TPP2-201ENST00000376052 5447 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 UNC93A-202ENST00000366829 1810 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 CORO2A-202ENST00000375077 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ACCSL-201ENST00000378832 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 MARK2P13-201ENST00000419108 1849 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 GEMIN4-201ENST00000319004 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 HAPLN1-201ENST00000274341 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF691-204ENST00000372506 1859 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 GPR55-202ENST00000392040 3828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 FAM153B-201ENST00000253490 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 POM121L1P-201ENST00000402027 1934 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 CPEB1-208ENST00000611163 1919 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 C10orf128-202ENST00000374151 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC22A16-201ENST00000330550 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SERPINA5-203ENST00000553780 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF619-204ENST00000447116 4153 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF207-204ENST00000394673 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ALKBH8-204ENST00000417449 2114 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF250-202ENST00000417550 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SEC14L3-207ENST00000540910 2113 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 CEACAM19-201ENST00000358777 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 POTEG-202ENST00000547848 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZP2-204ENST00000574091 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 POU6F1-202ENST00000389243 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 SIGLEC10-207ENST00000442846 2442 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 AHCYL1-201ENST00000359172 2503 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF17-206ENST00000601808 2524 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 CYP1A1-202ENST00000395048 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 FKBP9-212ENST00000490776 2699 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 LILRB1-201ENST00000324602 2774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF596-203ENST00000398612 2863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 ZIK1-207ENST00000599456 2860 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TMPRSS13-207ENST00000528626 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-4Q9BYR3 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms