Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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