Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms