Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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