Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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