Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms