Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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SOX4Q06945 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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SOX4Q06945 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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SOX4Q06945 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SOX4Q06945 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
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