Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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NRF1Q16656 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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NRF1Q16656 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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NRF1Q16656 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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NRF1Q16656 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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NRF1Q16656 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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