Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 HMGB4-203ENST00000519684 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GC-208ENST00000513476 1567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 AC008708.2-201ENST00000522956 1124 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC012513.3-201ENST00000623250 2116 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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