Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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