Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXD4Q12950 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXD4Q12950 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXD4Q12950 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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