Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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