Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TRHP20396 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 ZNF184-201ENST00000211936 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 AL356289.3-201ENST00000640049 2669 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TRHP20396 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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TRHP20396 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 SLC9B2-204ENST00000503230 1826 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRHP20396 TMEM108-AS1-202ENST00000505721 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 FGFR2-209ENST00000369056 2650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRHP20396 XCR1-201ENST00000309285 5281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TRHP20396 CENPL-201ENST00000345664 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TRHP20396 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 XIRP2-205ENST00000409605 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TRHP20396 AL356235.1-201ENST00000602791 2363 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 HSPD1P18-201ENST00000504252 244 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TRHP20396 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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