Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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